Новый пятиярусный иконостас выполнен в 2002 году. Старый, тоже пятиярусный иконостас был разобран в 1930-е годы. Он неоднократно дополнялся и перестраивался. Так, во время первого визита на Соловки в 1694г. царь Петр Первый пожаловал обители деньги на его подновление.
